La Universidad Nacional Agraria La Molina, desde el año 2005, ofrece el Programa de Doctorado en Recursos Hídricos (PDRH), orientado a la obtención del grado de Doctoris Philosophiae (PhD) en Recursos Hídricos, con el objetivo de formar profesionales de alto nivel, con profundos conocimientos en los fundamentos y aplicaciones de la ingeniería y gestión de los recursos hídricos para el uso racional y una gestión eficiente e integral del agua en un contexto del desarrollo sustentable y preservación de la biodiversidad de los medios acuáticos.
así mismo contribuye con la formación de profesionales con gran capacidad, destreza, independencia, iniciativa y creatividad, que a través de la investigación desarrollo e innovación desarrollen soluciones a la problemática del agua, el programa de doctorado cuenta con el soporte de profesores altamente calificados con experiencia en investigación, Convenios institucionales y moderna infraestructura en laboratorios.