La Facultad está integrada por tres Departamentos Académicos: Ordenamiento Territorial y Construcciones, Mecanización y Energía, así como Recursos Hídricos, que agrupan catedráticos de especialidades comunes o afines. Estos Departamentos Académicos realizan actividades de enseñanza, investigación, capacitación y proyección social en áreas como construcciones rurales, diseño estructural, diseño rural, energías renovables, ingeniería económica, mecánica de suelos, planeamiento rural, saneamiento rural, diseño y construcción de maquinaria agrícola, máquinas y equipos, energía, administración de proyectos de mecanización, riego y drenaje, riego presurizado, hidráulica e hidrología, manejo de cuencas (planeamiento y gestión), topografía, fotogrametría y Sistemas de Información Geográfica (SIG), entre otros.